alignment - MALDONADO LAB

Consejos para alineamiento múltiple de secuencias

15 de julio de 2021 at 21:05

Estos son mis TIPs para situaciones de alineamiento múltiple de secuencias Orientación de secuencias Algo extremadamente impotante a la hora de realizar un alineamiento múltiple es que todas las secuencias estén en la misma orientación. Cuando son 2 a 3 secuencias, la dirección se puede "ajustar" de forma manual mediante un alineamiento con blast (align2seqs) […]

BLAST: Ejemplos de comandos

220 Jonathan Maldonado

11 de mayo de 2021 at 15:17 (last edited 14 de septiembre de 2021 at 13:05)

Esta es una recopilación de los comandos que acostumbro a usar al momento de hacer una búsqueda por homología con BLAST. Los ejemplos están hechos en base a un blastn (nucleotídos contra nucleótidos) pero pueden ser adaptados a otros tipos de BLAST según el requerimiento. 1. Instalar BLAST en Ubuntu (o en Windows con WSL […]