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¿Necesitas obtener los genomas (ensambles) de todas las especies asociadas a algún taxid (cualquier nivel taxonómico)?, este es tu post. Primero es necesario tener el taxid que nos interesa. En este caso usaré el taxid de una familia de virus llamada Birnaviridae. Si seguimos este link, veremos que a la fecha existen 23 ensambles asociados […]
En esta página iré colocando algunos tips que voy aprendiendo en la medida que uso ambientes Anaconda. Consultar la versión de Anaconda conda -V or conda --version para conocer la versión de conda. python -V or python --version para conocer la versiónde Python. conda list anaconda$ para conocer la versión de Anaconda. conda list para conocer los detalles del nombre, versión, build, y […]
¿Quedó tan bien instalado el ambiente conda que deseas respaldarlo y/o replicarlo a otro usuario dentro de la misma máquina o en otra máquina? Dos alternativas: 1. Usar la info de paquetes del ambiente Copiar la info de paquetes mediante el siguiente comando conda env export .-n nombre_ambiente > ambiente.yml Para luego crear el nuevo […]
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