Un espacio para Ciencia y Bioinformática
¿Tienes un ensamble de genoma bacteriano y te gustaría representarlo como un genoma circular? Yo he utilizado DNAplotter, una herramienta java (multiplataforma) del Instituto Sanger bastante versátil y potente. I. Pasos previos alternativos: Si el genoma está fragmentado recomiendo ordenarlo por sesgo de GC y por tamaño de los scaffolds siguiendo el siguiente pipeline: En […]
¿Quedó tan bien instalado el ambiente conda que deseas respaldarlo y/o replicarlo a otro usuario dentro de la misma máquina o en otra máquina? Dos alternativas: 1. Usar la info de paquetes del ambiente Copiar la info de paquetes mediante el siguiente comando conda env export .-n nombre_ambiente > ambiente.yml Para luego crear el nuevo […]
Luego de realizar respados de archivos en GDrive utilizando mi cuenta institucional me vi en la necesidad de descargar algunos archivos para volver a procesarlos pero, ¿cómo los descargo usando línea de comandos en Linux?. Luego de buscar un poco y probar, logré encontrar un protocolo que funcionó (Octubre 2020). El siguiente es un tutorial […]
Si usas la app oficial Backup and Sync de Google para para sincronizar con Windows (o Mac) tus carpetas compartidas habrás notado que, en el directorio local (Windows) no aparecen los archivos o carpetas que te hayan compartido. Para lograr que aparezcan es necesario ir al administrador web de GDrive (drive.google.com) y mover el archivo/carpeta […]
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